La plate-forme GenoCellEdit a pour objectif de promouvoir l'édition à façon du génome des cellules, en particulier avec le système CRISPR/cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) dont la spécificité nucléasique est guidée par un petit ARN, appelé sgRNA.

De par sa conception simple, cet outil moléculaire apparu en 2012 a démocratisé les approches de modification ciblée du génome. Parce que le projet scientifique ne se résume pas au simple design du sgRNA, la plate-forme GenoCellEdit offre une solution complète, depuis le conseil dans la conception du projet jusqu'à la vectorisation de l'outil en passant par la formation technique.

La plate-forme GenoCellEdit est située au sein de l'UMR 1064-ITUN qui possède une expertise reconnue dans l'édition de gènes avec les nucléases artificielles et le transfert de gènes. En juin 2014, elle s'est ouverte à tous les laboratoires de recherche (académique en priorité). Au delà des prestations de routine, ses activités de R&D peuvent appuyer les projets innovants pour faire progresser la technologie et ses applications pour l'intérêt commun.

Savoir-faire

  • Design in silico des sgRNA ciblant le site génomique d'intérêt
  • Validation fonctionnelle in cellulo des sgRNA
  • Design du donneur ADN pour modifier à façon le génome et sa détection
  • Vectorisation de l'outil (plasmides, ARN, vecteurs viraux)
  • Conseil sur la stratégie, le type de Cas9, les vecteurs et leur utilisation

Types de prestations

  • Prestation de base : design et validation des sgRNA, vectorisation dans un plasmide, conseil et accompagnement du projet
  • Caractérisation de l'activité secondaire (off-target) (selon l'espèce)
  • Design et construction du donneur
  • Vectorisation sous forme d'ARNs synthétiques ou dans un vecteur viral recombinant tout-en-1 de type adénoviral ou lentiviral (intégratif, non intégratif)
  • Formation technologique à la détection des mutations induites
  • Prestation à façon: selon le souhait de l'utilisateur, des tâches peuvent être partagées avec la plate-forme pour une exploitation optimale des ressources respectives.
  • Recherche et développement

Exemples de réalisations

  • Invalidation d'un gène (KO)
  • Introduction d'une séquence d'intérêt dans un locus spécifique (KI)
  • Introduction d'une mutation spécifique
  • Correction d'une maladie génétique
  • Transgénèse dans de nombreux systèmes (végétaux, mammifères, ...) et organismes biologiques (cellules humaines, souris, rat, riz, ...)
genocelledit

Equipements

  • Biologie moléculaire
  • Biologie cellulaire

Applications

  • Biotechnologie: lignées productrices (transgènes introduits par un locus spécifique)
  • Création de modèles d'animaux (maladies, développement)
  • Etude fonctionnelle d'un gène à l'échelle cellulaire et de l'organisme
  • Imagerie cellulaire et de l'expression génique : Knock-in d'un gène rapporteur (Ex: GFP)
  • Ingénierie génétique des cellules iPS
  • Résistance à des pathogènes
  • Thérapie génique : insertion ciblée du vecteur, correction génique
  • Thérapie anti-virale