La plate-forme GenoCellEdit a pour objectif de promouvoir l'édition à façon du génome des cellules, en particulier avec le système CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)/cas9 dont la spécificité nucléasique est guidée par un petit ARN, appelé sgRNA. Apparu en 2012, cet outil moléculaire de par sa conception simple a démocratisé les approches de modification ciblée du génome. Parce que le projet scientifique ne se résume pas au simple design du sgRNA, la plate-forme GenoCellEdit offre une solution complète, depuis le conseil dans la conception du projet jusqu'à la vectorisation de l'outil et en passant par la formation technique.

GenoCelEdit est localisée au sein de l'UMR 1064-ITUN qui possède une expertise reconnue dans l'édition de gènes avec les nucléases artificielles et le transfert de gènes. En juin 2014, elle est devenue une plate-forme ouverte à tous les laboratoires de la recherche académique (en priorité) et privée. Au delà des prestations de routine, ses activités de R&D pourront appuyer les projets innovants pour faire progresser la technologie et ses applications pour l'intérêt commun.


Savoir-faire

Pour réussir les missions qui lui sont confiées, la plate-forme s'appuie sur plusieurs savoir-faire:
  • Design in silico des sgRNA ciblant le site génomique d'intérêt
  • Validation fonctionnelle in cellulo des sgRNA
  • Design du donneur ADN pour modifier à façon le génome et sa détection
  • Vectorisation de l'outil (plasmides, ARN, vecteurs viraux)
  • Conseil sur la stratégie, le type de Cas9, les vecteurs et leur utilisation

Types de prestations

  • Prestation de base: design et validation des sgRNA, vectorisation dans un plasmide, conseil et accompagnement du projet
  • Caractérisation de l'activité secondaire (off-target) (selon l'espèce)
  • Design et construction du donneur
  • Vectorisation sous forme d'ARNs synthétiques ou dans un vecteur viral recombinant tout-en-1 de type adénoviral ou lentiviral (intégratif, non intégratif)
  • Formation technologique à la détection des mutations induites
  • Prestation à façon: selon le souhait de l'utilisateur, des tâches peuvent être partagées avec la plate-forme pour une exploitation optimale des ressources respectives.
  • Recherche et développement

Exemples de réalisations

  • Invalidation d'un gène (Knock-out)
  • Introduction d'une séquence d'intérêt dans un locus spécifique (Knock-in)
  • Introduction d'une mutation spécifique
  • Correction d'une maladie génétique
  • Transgénèse dans de nombreux systèmes (Ex: végétaux, mammifères) et organismes biologiques (Ex: cellules humaines, souris, rat, riz).

Equipements

  • Equipement de biologie moléculaire
  • Equipement de biologie cellulaire

Applications

  • Biotechnologie: lignées productrices (transgènes introduits par un locus spécifique)
  • Création de modèles d'animaux (maladies, développement)
  • Etude fonctionnelle d'un gène à l'échelle cellulaire et de l'organisme
  • Imagerie cellulaire et de l'expression génique: Knock-in d'un gène rapporteur (Ex: GFP)
  • Ingénierie génétique des cellules iPS
  • Résistance à des pathogènes
  • Thérapie génique: insertion ciblée du vecteur, correction génique
  • Thérapie anti-virale